Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ECH1Q13011 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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