Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BPTFQ12830 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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