Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC3A1Q07837 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms