Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TNP2Q05952 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms