Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EGR4Q05215 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms