Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP7AQ04656 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP7AQ04656 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms