Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ERCC6Q03468 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERCC6Q03468 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms