Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDR2Q01850 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms