Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms