Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFITM3Q01628 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms