Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLTCQ00610 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms