Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMF1P82094 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMF1P82094 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMF1P82094 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMF1P82094 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms