Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX3P78415 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRX3P78415 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms