Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TUBB4BP68371 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TUBB4BP68371 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms