Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms