Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VSX2P58304 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VSX2P58304 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms