Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA9P57773 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA9P57773 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJA9P57773 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJA9P57773 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJA9P57773 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GJA9P57773 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms