Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIK1P57059 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIK1P57059 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIK1P57059 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIK1P57059 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK1P57059 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK1P57059 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SIK1P57059 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIK1P57059 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms