Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNB3P54284 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNB3P54284 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms