Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP98P52948 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP98P52948 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms