Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERFP50548 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERFP50548 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERFP50548 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERFP50548 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms