Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NUP153P49790 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP153P49790 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP153P49790 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP153P49790 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NUP153P49790 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NUP153P49790 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms