Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPAP49450 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPAP49450 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms