Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRT6CP48668 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT6CP48668 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT6CP48668 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRT6CP48668 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms