Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA4P43694 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA4P43694 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms