Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MDH1P40925 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MDH1P40925 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MDH1P40925 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MDH1P40925 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms