Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms