Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP62P37198 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms