Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACVR1BP36896 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ACVR1BP36896 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms