Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD13P35453 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD13P35453 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms