Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNGA1P29973 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms