Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB2P29033 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJB2P29033 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms