Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD1BP29016 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD1BP29016 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD1BP29016 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD1BP29016 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms