Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2AP24928 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2AP24928 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms