Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP1P23763 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms