Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TNFSF4P23510 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms