Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRGP23470 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRGP23470 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
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