Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EPHA1P21709 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA1P21709 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms