Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD33P20138 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD33P20138 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD33P20138 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD33P20138 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD33P20138 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD33P20138 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD33P20138 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD33P20138 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms