Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL3P19876 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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