Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSPP15924 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSPP15924 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSPP15924 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSPP15924 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSPP15924 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSPP15924 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms