Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM27P14373 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms