Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFTRP13569 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CFTRP13569 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CFTRP13569 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFTRP13569 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CFTRP13569 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CFTRP13569 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CFTRP13569 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CFTRP13569 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms