Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms