Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CYP2C9P11712 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CYP2C9P11712 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms