Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAMC1P11047 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMC1P11047 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms