Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C4AP0C0L4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C4AP0C0L4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms