Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VIL1P09327 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VIL1P09327 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIL1P09327 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIL1P09327 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIL1P09327 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VIL1P09327 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VIL1P09327 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms