Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACAA1P09110 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms