Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDHBP07195 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDHBP07195 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDHBP07195 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms